26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0436 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  100 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  34.15 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  32.46 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  36.61 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  31.78 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  37.4 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  32.32 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  36.36 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  36.54 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  30.33 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  31.53 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  40.23 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  42.86 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  39.08 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  37.93 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  37.93 
 
 		 113 aa  50.4  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  32.99 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  35.54 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  34.48 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  35.09 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  36.36 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  30.71 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  28.75 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  36.76 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  36.54 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  34.41 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>