28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0708 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  100 
 
 
113 aa  215  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  98.23 
 
 
113 aa  213  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  94.69 
 
 
113 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  85.84 
 
 
113 aa  153  8e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  71.56 
 
 
115 aa  103  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  34.55 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  35.45 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  41.44 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  35.45 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  31.86 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  34.55 
 
 
125 aa  70.1  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  34.55 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  46.59 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  37.11 
 
 
133 aa  67  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  42.35 
 
 
120 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  37.96 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  40.54 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  40.35 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  38.61 
 
 
120 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  35.05 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  40.19 
 
 
121 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  36.11 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  32.35 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  36.47 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  27.78 
 
 
131 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  34.04 
 
 
128 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  36.11 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  36.79 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>