20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0656 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  100 
 
 
113 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  35.71 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  33.03 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  33.33 
 
 
125 aa  60.5  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  33.01 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  29.13 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  33.01 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  40.54 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  30.86 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  34.57 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  34.57 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  30.86 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  32.1 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  34.21 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  33.87 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  32.1 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  31.15 
 
 
121 aa  42  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  32.43 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  32.26 
 
 
115 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>