28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0082 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0082  prefoldin subunit beta  100 
 
 		 128 aa  248  3e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0164656  hitchhiker  0.000222575 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1787  prefoldin, beta subunit  62.5 
 
 		 126 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.023483  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0341  prefoldin, beta subunit  44.64 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0831  prefoldin, beta subunit  46.67 
 
 		 125 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0777501 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1376  prefoldin, beta subunit  43.81 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.753867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0931  prefoldin, beta subunit  41.82 
 
 		 125 aa  87  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1942  prefoldin, beta subunit  40 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2110  prefoldin, beta subunit  33.87 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1672  prefoldin, beta subunit  37.74 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2449  prefoldin, beta subunit  36.19 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0567  prefoldin, beta subunit  27.43 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.707557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1817  prefoldin, beta subunit  31.67 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.674305 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1486  prefoldin, beta subunit  32.99 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1336  hypothetical protein  35.34 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.484588  normal  0.0167667 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1357  prefoldin, beta subunit  36.26 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0008  prefoldin, beta subunit  37.96 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.465304  normal  0.352896 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1247  prefoldin, beta subunit  35.87 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0436  prefoldin subunit beta  30.71 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000813008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1258  prefoldin, beta subunit  30.59 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1428  prefoldin, beta subunit  33.7 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0708  prefoldin, beta subunit  34.78 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0656  prefoldin subunit beta  36.36 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.963638  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1123  prefoldin, beta subunit  37.86 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00123512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2288  prefoldin, beta subunit  32.11 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0175  prefoldin, beta subunit  31.75 
 
 		 115 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.697997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0213  prefoldin, subunit beta  33.04 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2676  prefoldin, beta subunit  30.77 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0205  prefoldin, beta subunit  33.93 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.402799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>