12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2024 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2024  TIR protein  100 
 
 		 163 aa  336  8e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6381  hypothetical protein  29.29 
 
 		 414 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4259  hypothetical protein  27.17 
 
 		 847 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178114  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.69 
 
 		 1348 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0094  TIR protein  30.23 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.5 
 
 		 1363 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 947 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  31.96 
 
 		 544 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  24.76 
 
 		 1048 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1283 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 1016 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  27.18 
 
 		 1016 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>