297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03975 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03975  putative transposase  100 
 
 
87 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02543  putative transposase  95.4 
 
 
118 aa  176  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04569  putative transposase  95.4 
 
 
118 aa  176  7e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00830  putative transposase  94.92 
 
 
95 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00230635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00935  putative transposase  94.92 
 
 
98 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06102  putative transposase  94.92 
 
 
98 aa  121  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658107  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1840  hypothetical protein  67.8 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1850  hypothetical protein  67.8 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.111337 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1511  hypothetical protein  67.8 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1712  hypothetical protein  67.8 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1565  hypothetical protein  66.1 
 
 
99 aa  90.1  8e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.624462 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1672  hypothetical protein  61.67 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.446389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  52 
 
 
275 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0457  insertion element transposase  58.33 
 
 
222 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  58.33 
 
 
284 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  58.33 
 
 
284 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  58.33 
 
 
279 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1782  hypothetical protein  65.79 
 
 
46 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.587124 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0334  transposase  52.27 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0743  transposase  52.27 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.220437  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0747  transposase  52.27 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  53.06 
 
 
287 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4140  transposase, IS4 family protein  53.06 
 
 
287 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.728837  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2941  transposase, IS4 family protein  53.06 
 
 
287 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00010535  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  52.38 
 
 
308 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4596  transposase IS4 family protein  26.85 
 
 
184 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  40.35 
 
 
274 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4410  transposase  53.66 
 
 
127 aa  53.5  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  52.63 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5164  transposase  53.66 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4932  transposase  53.66 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.333963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2319  transposase  53.66 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1824  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.312026  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1440  transposase  53.66 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.624391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2487  transposase  53.66 
 
 
129 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0453  transposase  51.22 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.347908  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2123  transposase  51.22 
 
 
127 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00183636  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4253  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4263  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519953  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4525  transposase  51.22 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0339658  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3551  transposase  51.22 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.402831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3641  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.336877  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3169  transposase  51.22 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2752  transposase  51.22 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.283972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5096  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3939  transposase  51.22 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4400  transposase  51.22 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0121256  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1623  transposase  53.66 
 
 
127 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180817  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1657  transposase  53.66 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2176  transposase  51.22 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  40.54 
 
 
275 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  47.5 
 
 
254 aa  50.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2849  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2007  transposase  48.78 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  53.66 
 
 
155 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  50 
 
 
283 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  47.5 
 
 
251 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3838  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2390  transposase IS4 family protein  41.54 
 
 
274 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1195  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.54444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3503  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1883  transposase  51.22 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5118  transposase  48.78 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000360467  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  43.9 
 
 
253 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  40.82 
 
 
250 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  42.5 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>