19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03963 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  390  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  39.04 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  41.04 
 
 
188 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  37.98 
 
 
224 aa  126  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  40.46 
 
 
182 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  37.5 
 
 
232 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  41.04 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  41.04 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  37.43 
 
 
247 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  34.81 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  33.33 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  31.94 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  26.51 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  30.54 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  30.54 
 
 
259 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  29.94 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.65 
 
 
377 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  28.12 
 
 
270 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  22.36 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>