13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0005 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  100 
 
 		 377 aa  654    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  32.76 
 
 		 270 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41316  predicted protein  28.61 
 
 		 380 aa  53.9  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  40.28 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  34.55 
 
 		 203 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  33.64 
 
 		 215 aa  48.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  44.44 
 
 		 971 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  40.79 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  40.79 
 
 		 182 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  35.59 
 
 		 268 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  38.67 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  34.67 
 
 		 188 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  41.82 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>