19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0171 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  100 
 
 
248 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  45.51 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  47.78 
 
 
219 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  39.88 
 
 
268 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  35.64 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  31.82 
 
 
215 aa  95.5  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  35.83 
 
 
203 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  38.79 
 
 
259 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  38.79 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  38.79 
 
 
259 aa  89.4  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  33.33 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  30.64 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  33.54 
 
 
182 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  29.59 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  30.32 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  33.33 
 
 
377 aa  48.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  23.65 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>