18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6497 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  361  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  95.6 
 
 
182 aa  350  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  60.99 
 
 
188 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  40.86 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  42.05 
 
 
224 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  39.31 
 
 
203 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  38.8 
 
 
232 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  36.59 
 
 
247 aa  94.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  31.71 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  33.33 
 
 
219 aa  77.4  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  32.93 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  31.36 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  31.71 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  31.1 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  31.71 
 
 
259 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  28.57 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.79 
 
 
377 aa  49.3  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>