20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6321 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  100 
 
 
259 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  96.5 
 
 
259 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  96.5 
 
 
259 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  53.07 
 
 
268 aa  188  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  41.94 
 
 
219 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  38.79 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  36.75 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  34.76 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  31.21 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  27.49 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  30.77 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  32.34 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  34.13 
 
 
260 aa  63.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  29.33 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  28.49 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2926  hypothetical protein  29.31 
 
 
198 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687011  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0005  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  32.39 
 
 
377 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>