19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4908 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  450  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  36.82 
 
 		 203 aa  118  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  33.82 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  37.7 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  37.64 
 
 		 188 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  32.86 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  38.8 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  38.8 
 
 		 182 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  34.57 
 
 		 248 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  38.27 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  33.52 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  36.08 
 
 		 260 aa  91.7  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  36.42 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  31.79 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  31.79 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  31.79 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  29.3 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  30.6 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2926  hypothetical protein  31.82 
 
 		 198 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687011  normal  0.364425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>