16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1895 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  502  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  36.08 
 
 
232 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  30.77 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  31.36 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  32.53 
 
 
188 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  34.13 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  34.13 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  29.26 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  34.13 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  30.77 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  32.32 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  25.15 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  24.52 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>