17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4909 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4909  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  438  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal  0.356992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3000  hypothetical protein  46.04 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  47.09 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  42.29 
 
 		 182 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  42.05 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  42.05 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  37.02 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  32.52 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  36.72 
 
 		 247 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  34.1 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  31.43 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0171  putative secreted protein  30.64 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0836284  hitchhiker  0.00335294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  30.68 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  30.11 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1895  hypothetical protein  29.53 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402097 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  30.11 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  24.1 
 
 		 270 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>