26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03933 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  199  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  57.14 
 
 
94 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0389  hypothetical protein  50.52 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0447  hypothetical protein  50.52 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.145575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  42.37 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  42.11 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  36.05 
 
 
107 aa  48.9  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  35.62 
 
 
117 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  35.8 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  37.37 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  36.99 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  41.51 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  31.58 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  48.57 
 
 
106 aa  43.5  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  33.78 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  35.9 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  34.52 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  41.07 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  36.23 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>