30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2466 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  46.32 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  44.16 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  43.33 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  39.82 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  48.61 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  36.7 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  36.96 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  50.72 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  47.06 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  52.17 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  52.17 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  44.78 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  44.78 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  34.41 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  35.45 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  44.93 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  41.18 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  37.78 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  37.78 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  52.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  40.62 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  34.94 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  42.11 
 
 		 94 aa  47.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  38.57 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0389  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.145575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>