28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0137 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  98.95 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  96.84 
 
 		 95 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  75.79 
 
 		 95 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  75.26 
 
 		 98 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  77.08 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  74.74 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  78.12 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  71.58 
 
 		 95 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  78.08 
 
 		 94 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  54.93 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  45.78 
 
 		 90 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  44.93 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  41.79 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  47.76 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  37.36 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  46.97 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  41.18 
 
 		 117 aa  53.9  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  35.06 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  39.71 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  31.96 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  36.92 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  30 
 
 		 111 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  30 
 
 		 111 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  28.41 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>