28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  197  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  70.83 
 
 
96 aa  139  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  63.16 
 
 
95 aa  130  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  62.11 
 
 
95 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  71.58 
 
 
95 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  61.86 
 
 
98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  71.58 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  71.58 
 
 
95 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  73.08 
 
 
95 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  78.87 
 
 
96 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  73.33 
 
 
94 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  55.07 
 
 
117 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  43.68 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  48.53 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  52.24 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  38.68 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  47.06 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  39.74 
 
 
121 aa  60.8  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  42.03 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  38.68 
 
 
107 aa  57  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  40.23 
 
 
121 aa  57  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  44.12 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  38.89 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  34.78 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  36.76 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  34.78 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  30.88 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  30.88 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>