20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0389 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0447  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.145575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0389  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  202  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  50 
 
 
94 aa  107  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  50.52 
 
 
96 aa  95.1  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  45.31 
 
 
109 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  42.19 
 
 
107 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  44.64 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  38.71 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  42.11 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  34.33 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  37.5 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  34.74 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  36.67 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  36.67 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1929  hypothetical protein  31.17 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0504426  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  36.92 
 
 
107 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  35.09 
 
 
112 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  48.57 
 
 
125 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  35.9 
 
 
94 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1842  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.541159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>