28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6295 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  97.92 
 
 
96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  76.04 
 
 
95 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  73.96 
 
 
95 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  71.43 
 
 
98 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  79.17 
 
 
95 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  78.12 
 
 
95 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  78.12 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  78.12 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  77.08 
 
 
94 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  77.03 
 
 
95 aa  125  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  48.86 
 
 
117 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  52.46 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  46.27 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  50.72 
 
 
117 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  39.56 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  46.97 
 
 
151 aa  62  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  44.93 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  46.15 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  41.56 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  47.62 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  45.59 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  32.35 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  39.44 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  35.71 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  36.23 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  27.88 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  27.88 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>