28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0153 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  193  8.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  77.08 
 
 		 96 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  71.58 
 
 		 95 aa  140  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  70.53 
 
 		 95 aa  140  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  84.72 
 
 		 96 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  74.39 
 
 		 95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  71.95 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  65.98 
 
 		 98 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  71.95 
 
 		 95 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  78.08 
 
 		 95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  73.33 
 
 		 95 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  51.25 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  48.78 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  48.57 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  43.28 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  41.03 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  45.05 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  46.97 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  50.79 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  35.78 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  41.67 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  37.5 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  42.42 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  33.82 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  33.82 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  34.52 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  37.14 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>