28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5106 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  9e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  96.84 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  96.84 
 
 		 95 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  95.79 
 
 		 95 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  78.12 
 
 		 96 aa  157  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  74.23 
 
 		 98 aa  156  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  73.68 
 
 		 95 aa  154  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  72.63 
 
 		 95 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  79.17 
 
 		 96 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  72.63 
 
 		 94 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  69.47 
 
 		 95 aa  126  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  54.93 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  53.33 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  43.28 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  46.38 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  47.76 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  39.42 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  43.42 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  44.93 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  37.66 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0165  hypothetical protein  32.73 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  32.29 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2694  conserved hypothetical secreted protein  31.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.551286  hitchhiker  0.00000908277 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3096  hypothetical protein  31.11 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0046  hypothetical protein  37.88 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03933  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  35.71 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>