23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0057 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0057  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72500  hypothetical protein  71.43 
 
 		 96 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0345  hypothetical protein  65.98 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0139  hypothetical protein  75.26 
 
 		 95 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0122  hypothetical protein  75.26 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0271  hypothetical protein  64.95 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0137  hypothetical protein  75.26 
 
 		 95 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5106  hypothetical protein  74.23 
 
 		 95 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6295  hypothetical protein  71.43 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0153  hypothetical protein  65.98 
 
 		 94 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00640  hypothetical protein  61.86 
 
 		 95 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.860448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0556  hypothetical protein  52.05 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.88275  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0085  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.551447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3815  hypothetical protein  38.03 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0547  hypothetical protein  36.92 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.108831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0360  hypothetical protein  43.48 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0868173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0542  hypothetical protein  33.73 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0566  hypothetical protein  46.3 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2466  hypothetical protein  38.57 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.939512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2451  hypothetical protein  35.92 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2423  hypothetical protein  35.44 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.455047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3942  putative secreted protein  27.55 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2862  hypothetical protein  33.93 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>