58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02028 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02028  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  186  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.326334  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1267  OsmC family protein  53.03 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1301  OsmC family protein  53.03 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0499071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1390  OsmC family protein  53.03 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0908  OsmC-like protein  53.03 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1368  OsmC family protein  53.03 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0210899 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0921  OsmC family protein  49.33 
 
 
136 aa  67.4  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.418667  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4533  OsmC-like protein  51.52 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  50 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  50 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  47.37 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  50 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1950  OsmC family protein  48.48 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  43.42 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  45.45 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  49.28 
 
 
410 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0974  OsmC family protein  48.48 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  44.16 
 
 
405 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6635  OsmC family protein  41.56 
 
 
411 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  hitchhiker  0.00000360166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2717  OsmC-like protein  42.03 
 
 
135 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  43.59 
 
 
406 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  40.26 
 
 
406 aa  50.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4937  OsmC family protein  37.93 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.659641 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  37.66 
 
 
415 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1206  OsmC family protein  44.16 
 
 
413 aa  48.9  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.423514  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12698  hypothetical protein  39.44 
 
 
405 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  35.06 
 
 
402 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  40.26 
 
 
406 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  46.97 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1840  hypothetical protein  43.48 
 
 
405 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.949047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3762  OsmC family protein  39.73 
 
 
410 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0518  OsmC-like protein superfamily protein  41.67 
 
 
153 aa  47.4  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  40.26 
 
 
407 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  41.56 
 
 
412 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  38.36 
 
 
410 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  44.16 
 
 
409 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1438  OsmC family protein  39.34 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.139134 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5525  OsmC family protein  35.9 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  41.56 
 
 
407 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  37.88 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0240  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0949  hydrolase  38.46 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1423  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3725  OsmC family protein  37.18 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.196532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4564  OsmC-like protein  37.18 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3799  OsmC family protein  37.18 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.732158  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2518  hypothetical protein  38.46 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0608844  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2657  putative hydrolase  38.46 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3689  OsmC family protein  35.9 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.952273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  40 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  38.57 
 
 
423 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1082  OsmC-like family protein  35.48 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0521945  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2297  OsmC-like protein  35.9 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.922047  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3491  OsmC family protein  32.81 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2658  OsmC family protein  27.06 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.653298  normal  0.498397 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  38.36 
 
 
409 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0979  OsmC family protein  35.48 
 
 
418 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0251  OsmC family protein  39.34 
 
 
134 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.798103  normal  0.164531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>