45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4071 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  89.53 
 
 		 191 aa  357  7e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  56.84 
 
 		 194 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  56.32 
 
 		 195 aa  221  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  54.74 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  39.88 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  42.16 
 
 		 191 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  41.24 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  37.57 
 
 		 182 aa  140  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  41.14 
 
 		 179 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  34.68 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  33.33 
 
 		 216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  38.15 
 
 		 176 aa  123  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  36.87 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  35.87 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  36 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  29.41 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  35.03 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  31.07 
 
 		 197 aa  99.8  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  26.86 
 
 		 178 aa  98.2  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  32.47 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  28.37 
 
 		 222 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  27.4 
 
 		 222 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  32.39 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  27 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  29.73 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  30.23 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  85.1  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  31.28 
 
 		 198 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  29.83 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  30.98 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  31.84 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  31.28 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  31.28 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  28.73 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  31.28 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  31.61 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0316  hypothetical protein  26.26 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  25.96 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  29.24 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  30.3 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  31.41 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  32.21 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  27.13 
 
 		 243 aa  41.2  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>