39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07990 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  75 
 
 
203 aa  305  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  58.51 
 
 
193 aa  216  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  56.92 
 
 
195 aa  210  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  53.47 
 
 
197 aa  199  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  37.5 
 
 
194 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  36.96 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  35.52 
 
 
191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  33.71 
 
 
191 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  32.43 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  30.86 
 
 
181 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  33.52 
 
 
182 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  30.23 
 
 
191 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  31.18 
 
 
179 aa  88.2  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  30.06 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  33.11 
 
 
176 aa  85.1  7e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  34.69 
 
 
295 aa  77.4  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  25.41 
 
 
193 aa  75.9  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  27.14 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  29.68 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  28.14 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  27.14 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  27.14 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  27.14 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  27.14 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  27.14 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  29.94 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  26.9 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  27.37 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  26.83 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  24.49 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  23.86 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  25.66 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  23 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  25.58 
 
 
197 aa  62  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  21.5 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  25.31 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  23.2 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  36.23 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>