27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2670 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  348  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  59.66 
 
 
208 aa  207  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  55.56 
 
 
207 aa  180  8.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  51.72 
 
 
243 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  51.72 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  41.38 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  43.97 
 
 
151 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  33.54 
 
 
235 aa  101  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0174  hypothetical protein  31.58 
 
 
250 aa  89.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  30.19 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  37.14 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  32.18 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  32.21 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  32.31 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  32.39 
 
 
194 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  22.7 
 
 
193 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  30.47 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  26.14 
 
 
199 aa  48.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  26.95 
 
 
222 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  29.45 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  29.37 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  25.49 
 
 
222 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  21.12 
 
 
200 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3090  fibronectin type III domain-containing protein  30.97 
 
 
862 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  26.56 
 
 
216 aa  42.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  29.13 
 
 
1154 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  27.55 
 
 
211 aa  40.8  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>