31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2053 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  100 
 
 
207 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  65.87 
 
 
208 aa  277  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  55.06 
 
 
174 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  45.15 
 
 
200 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  44.25 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  36.84 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  42.86 
 
 
151 aa  118  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  32.03 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0174  hypothetical protein  27.64 
 
 
250 aa  89.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  25.9 
 
 
209 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  29.24 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  32.41 
 
 
191 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  29.19 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  27.78 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  25.77 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  35.25 
 
 
176 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  26.39 
 
 
222 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  33.86 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  29.92 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  30.66 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  28.91 
 
 
180 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  26.49 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  24.65 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  23.13 
 
 
216 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  23.48 
 
 
178 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  24.55 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  27.54 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  25.74 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  29.05 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  29.66 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  24.86 
 
 
198 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>