16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  46.83 
 
 
208 aa  171  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  51.72 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  43.69 
 
 
207 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  43 
 
 
243 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  32.34 
 
 
235 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  35.29 
 
 
191 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  38.73 
 
 
151 aa  93.2  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0174  hypothetical protein  27.93 
 
 
250 aa  87  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  29.08 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  30.53 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  25.52 
 
 
222 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  25.3 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  24.83 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  24.73 
 
 
209 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  34.43 
 
 
176 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>