34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2174 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  51.72 
 
 
174 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  43.6 
 
 
208 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  43.86 
 
 
207 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  43 
 
 
200 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0174  hypothetical protein  35.09 
 
 
250 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  32.26 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  31.68 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  33.55 
 
 
151 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  26.96 
 
 
209 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  26.78 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  27.53 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  29.25 
 
 
222 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  25.42 
 
 
198 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  25.41 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  24.21 
 
 
198 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  31.48 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  26.04 
 
 
199 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  23.89 
 
 
198 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  26.14 
 
 
179 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  22.91 
 
 
183 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  23.89 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  24.44 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  24.29 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  24.29 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  24.44 
 
 
198 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  23.89 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  28.41 
 
 
197 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  26.63 
 
 
195 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  23.08 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  25.54 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  21.93 
 
 
216 aa  43.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  25.68 
 
 
176 aa  42.7  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07070  alpha-glucuronidase  27.61 
 
 
1154 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.509455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>