42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1434 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  400  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  96.69 
 
 
151 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  41.38 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  37.08 
 
 
208 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  38.24 
 
 
207 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  35.29 
 
 
200 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  32.26 
 
 
243 aa  94  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0174  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  94  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  32.94 
 
 
176 aa  89.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  34.06 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  27.68 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  27.78 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  28.34 
 
 
216 aa  72  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  27.27 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  26.13 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  26.92 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  32 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  29.11 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  28.22 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  24.73 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  27.03 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  30.07 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  25.13 
 
 
222 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  25.75 
 
 
195 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  26.32 
 
 
178 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  24.86 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  24.31 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  26.71 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  24.05 
 
 
198 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  25 
 
 
181 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  27.74 
 
 
191 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  24.24 
 
 
198 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  24.03 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  24.03 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  24.03 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  24.03 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  23.64 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  24.03 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  24.03 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  24.03 
 
 
198 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  21.79 
 
 
199 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0316  hypothetical protein  31.25 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>