87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3260 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3260  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
209 aa  433  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3098  GCN5-related N-acetyltransferase  87.2 
 
 
164 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  61.59 
 
 
166 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2052  GCN5-related N-acetyltransferase  54.37 
 
 
170 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.803616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2415  acetyltransferase  53.75 
 
 
210 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  53.75 
 
 
165 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.838231  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0646  acetyltransferase, gnat family  31.08 
 
 
169 aa  88.6  6e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.46406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2036  GCN5-related N-acetyltransferase  34.82 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  29.52 
 
 
163 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
151 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
156 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.19 
 
 
159 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  24.38 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4033  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.910853  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  21.74 
 
 
160 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
347 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  28.07 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
178 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.04 
 
 
291 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2720  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
156 aa  48.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
170 aa  48.5  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
157 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0431  Prolyl aminopeptidase  30.77 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  25 
 
 
319 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
349 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2641  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.69 
 
 
349 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3300  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0928337  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
160 aa  46.2  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
172 aa  46.2  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
340 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  23.29 
 
 
164 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
320 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8209  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.14 
 
 
291 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2005  acetyltransferase  24.32 
 
 
162 aa  45.4  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.145505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
291 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  24.82 
 
 
163 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1612  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122446  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1336  GCN5-related N-acetyltransferase  26.26 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0265  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
160 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 
166 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3348  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
162 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3555  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.561204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  25.52 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  35.62 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  35.62 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  35.62 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  35.62 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  35.62 
 
 
167 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3701  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
161 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  24.82 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  26.27 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1265  GCN5-like N-acetyltransferase  28.85 
 
 
153 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  24.11 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  25.23 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
347 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  30.43 
 
 
184 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
149 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
322 aa  42.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3406  acetyltransferase  27.61 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.344947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
153 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
166 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2540  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
159 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00777279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2356  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
159 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0312  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.648752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  25.35 
 
 
167 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
160 aa  42  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
161 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4396  GCN5-related N-acetyltransferase  32.98 
 
 
261 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.264466  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3911  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
178 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
156 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
175 aa  41.6  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4320  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
151 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.433453  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0568  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
180 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
128 aa  41.2  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>