53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2052 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2052  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 170 aa  345  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.803616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2415  acetyltransferase  89.35 
 
 		 210 aa  309  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3280  GCN5-related N-acetyltransferase  90.3 
 
 		 165 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.838231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1924  GCN5-related N-acetyltransferase  76.4 
 
 		 166 aa  253  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.13474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3098  GCN5-related N-acetyltransferase  56.88 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3260  acetyltransferase, GNAT family  54.37 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0366383  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0646  acetyltransferase, gnat family  33.53 
 
 		 169 aa  97.1  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.46406  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2036  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2381  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1070  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.543487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12708  putative acetyltransferase  27.16 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0426  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.18 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  40 
 
 		 322 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5056  GCN5-related N-acetyltransferase  20.62 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  45.45 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  31.31 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  38.46 
 
 		 319 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.19 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5585  acetyltransferase protein  36.05 
 
 		 180 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155048  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2130  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 163 aa  44.3  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  38.46 
 
 		 319 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  37.68 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4736  acetyltransferase  37.1 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.315078  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0971  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  22.64 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3741  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4759  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4729  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4878  GNAT family acetyltransferase  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3756  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4822  acetyltransferase, gnat family  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4858  GNAT family acetyltransferase  32.91 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.723134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2409  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 		 160 aa  42  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.375417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  37.1 
 
 		 167 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1340  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  30.38 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2792  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 172 aa  41.6  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0755  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 		 170 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2487  acetyltransferase  24.6 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.184909  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.17 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04122  predicted acetyltransferase  35.48 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04086  hypothetical protein  35.48 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5777  acetyltransferase, GNAT family  35.48 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 		 153 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593041  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 301 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>