20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5133 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  881    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  88.34 
 
 		 474 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  95.25 
 
 		 463 aa  699    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  99.35 
 
 		 463 aa  876    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  67.32 
 
 		 459 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  69.93 
 
 		 457 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  69.5 
 
 		 459 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  66.45 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  67.11 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  68.7 
 
 		 463 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  63.5 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  51.52 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  46.06 
 
 		 507 aa  265  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  37.05 
 
 		 469 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  32.52 
 
 		 468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  31.37 
 
 		 446 aa  130  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  31.32 
 
 		 469 aa  126  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  28.57 
 
 		 441 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  29.57 
 
 		 476 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0949  hypothetical protein  27.54 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>