20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0150 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  894    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  48.48 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  51.52 
 
 		 463 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  51.73 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  50.53 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  48.04 
 
 		 459 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  47.7 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  51.3 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  48.62 
 
 		 459 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  48.83 
 
 		 461 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  50.33 
 
 		 463 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  47.74 
 
 		 463 aa  262  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  47.65 
 
 		 507 aa  256  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  40.24 
 
 		 469 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  29.4 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  28.64 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  28.06 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  24.84 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  25.6 
 
 		 476 aa  97.1  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0949  hypothetical protein  29.29 
 
 		 513 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>