20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0510 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  953    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  45.23 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  45.38 
 
 
457 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  47.65 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  46.96 
 
 
474 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  46.25 
 
 
463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  44.51 
 
 
459 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  46.04 
 
 
463 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  46.12 
 
 
463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  47.25 
 
 
459 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  46.4 
 
 
461 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  43.61 
 
 
463 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  43.15 
 
 
463 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  27.1 
 
 
446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  27.41 
 
 
468 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  27.29 
 
 
469 aa  127  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  31.39 
 
 
469 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  26.23 
 
 
441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  28.12 
 
 
476 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0949  hypothetical protein  26.05 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>