20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1203 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  66.88 
 
 
469 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  913    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  67.95 
 
 
468 aa  648    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  26.11 
 
 
441 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  27.46 
 
 
507 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  32.52 
 
 
463 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  29.33 
 
 
459 aa  107  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  32.52 
 
 
463 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  29.95 
 
 
468 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  32.63 
 
 
474 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  30 
 
 
459 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  32.87 
 
 
463 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  27.27 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  29.13 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  28.74 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  28.74 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  29.02 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  30.14 
 
 
463 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  27.3 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0949  hypothetical protein  23.93 
 
 
513 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>