20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1299 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  90.6 
 
 
469 aa  875    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  67.95 
 
 
446 aa  648    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  100 
 
 
468 aa  959    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  34.39 
 
 
459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  29.11 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  33.47 
 
 
463 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  35.18 
 
 
459 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  33.47 
 
 
463 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  26.63 
 
 
441 aa  106  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  32.94 
 
 
474 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  32.67 
 
 
463 aa  100  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  29.7 
 
 
468 aa  99.4  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  33.63 
 
 
461 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  27.99 
 
 
457 aa  87  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  33.73 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  29.56 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  31.6 
 
 
463 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  30.11 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  26.69 
 
 
476 aa  62  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0949  hypothetical protein  24.68 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>