19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_04520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0438  hypothetical protein  96.1 
 
 
459 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04520  hypothetical protein  100 
 
 
461 aa  859    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00698183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0438  hypothetical protein  65.78 
 
 
459 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5362  hypothetical protein  64.41 
 
 
457 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5133  hypothetical protein  67.11 
 
 
463 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.908181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4736  hypothetical protein  67.11 
 
 
459 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0332  hypothetical protein  66.38 
 
 
474 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5006  hypothetical protein  67.11 
 
 
463 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5185  hypothetical protein  67.77 
 
 
463 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0369214  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4211  hypothetical protein  68.03 
 
 
463 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48130  hypothetical protein  66.59 
 
 
463 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.275385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0150  hypothetical protein  49.04 
 
 
468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0510  hypothetical protein  49.88 
 
 
507 aa  259  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3225  hypothetical protein  36.74 
 
 
469 aa  153  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1299  hypothetical protein  33.14 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1119  hypothetical protein  31.16 
 
 
469 aa  126  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.506794 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1203  hypothetical protein  28.57 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4058  hypothetical protein  26.82 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3495  hypothetical protein  28.32 
 
 
476 aa  99.8  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>