37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4302 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  91.75 
 
 		 291 aa  441  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  86.43 
 
 		 292 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  87.24 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  52.63 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3629  Urea transporter-like protein  82.24 
 
 		 190 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  39.65 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  31.05 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  24.91 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  29.66 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  28.85 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  28.85 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  28.85 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  26.96 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3835  putative transporter  37.85 
 
 		 304 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  30.45 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  29.21 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45060  putative transporter  37.41 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  29.21 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  30.68 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  33.63 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  29.92 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  29.1 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  29.37 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  29.37 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  27.27 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  24.65 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  24.65 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  33.62 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  29.92 
 
 		 337 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  26.88 
 
 		 347 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  32.84 
 
 		 371 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  28.78 
 
 		 432 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  33.08 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  29.46 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  26.99 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  28.36 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>