37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4874 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  100 
 
 
314 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  78.66 
 
 
314 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  57.23 
 
 
316 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  46.23 
 
 
296 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  46.42 
 
 
296 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  46.08 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  45.54 
 
 
296 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  45.54 
 
 
296 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  46.23 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  32.2 
 
 
321 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  28.52 
 
 
301 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  28.52 
 
 
301 aa  100  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4014  Urea transporter  45.61 
 
 
298 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801386 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  27.04 
 
 
371 aa  92  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  25.84 
 
 
286 aa  87.8  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  26.41 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  35.62 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  29.19 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  26.57 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  27.82 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  25 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  27.24 
 
 
350 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  27.99 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  27.99 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  27.99 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  28.72 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  28.62 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  31.83 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  27.82 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  29.79 
 
 
290 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  26.71 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  29.76 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  29.8 
 
 
432 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  27.48 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  29.7 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  26.71 
 
 
337 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  27.61 
 
 
292 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>