34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5121 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  100 
 
 
338 aa  650    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  87.57 
 
 
337 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  87.28 
 
 
337 aa  551  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  45.13 
 
 
350 aa  239  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  40 
 
 
330 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  40 
 
 
330 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  40 
 
 
330 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  36.75 
 
 
321 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  34.46 
 
 
337 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  29.93 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  32.24 
 
 
371 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  34.55 
 
 
344 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  30.18 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  28.91 
 
 
301 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  28.91 
 
 
301 aa  105  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  29.74 
 
 
290 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  26.69 
 
 
286 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  31.85 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  27.72 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3835  putative transporter  32.78 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  26.48 
 
 
432 aa  63.5  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  31.69 
 
 
330 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45060  putative transporter  31.31 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  28.34 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  27.76 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  28.35 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  29.87 
 
 
292 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  28.35 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  29.84 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  28.38 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  27.4 
 
 
314 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  27.93 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  27.82 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  31.44 
 
 
297 aa  43.5  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>