36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0682 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  100 
 
 
312 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  31.06 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  31.06 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  34.13 
 
 
337 aa  153  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  34.19 
 
 
330 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  34.19 
 
 
330 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  34.19 
 
 
330 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  30 
 
 
338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  30.69 
 
 
350 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  28.2 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  29.18 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  31.71 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  29.18 
 
 
337 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  31.16 
 
 
286 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  33.45 
 
 
300 aa  119  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  28.66 
 
 
371 aa  114  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  29.39 
 
 
281 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  28.62 
 
 
347 aa  99.4  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  27.63 
 
 
290 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  26.86 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  27.22 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  26.41 
 
 
314 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  29.41 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  30 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  31.1 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  24.75 
 
 
296 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  31.82 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  24.6 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  24.08 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  25.64 
 
 
432 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  25.99 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  23.71 
 
 
330 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  25.99 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  26.64 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  26.47 
 
 
297 aa  52.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  32.31 
 
 
303 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>