22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39772 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  100 
 
 
432 aa  868    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  27.7 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  28.27 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  27.64 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  25.31 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  27.64 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  27.56 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  27.56 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  27.56 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  27.74 
 
 
347 aa  64.7  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  26.48 
 
 
338 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  26.37 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  29.68 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  24.33 
 
 
301 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  24.33 
 
 
301 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  25.69 
 
 
290 aa  57  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  27.01 
 
 
344 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  30.77 
 
 
296 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  29.8 
 
 
314 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  27.27 
 
 
321 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  29.8 
 
 
296 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  28.57 
 
 
291 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>