34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4532 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  100 
 
 		 296 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  94.59 
 
 		 296 aa  481  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  81.82 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  81.82 
 
 		 296 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  83.16 
 
 		 297 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  81.82 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4014  Urea transporter  79.53 
 
 		 298 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801386 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  46.85 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  46.15 
 
 		 314 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  46.1 
 
 		 316 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  30.1 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  26.13 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  26.13 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  28.23 
 
 		 337 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  25.26 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  24.64 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  24.46 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  27.12 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  28.81 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  26.85 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  26.85 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  26.85 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  26.35 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  24.92 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  29.49 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  27.61 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  28.76 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  27.61 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  30.52 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  22.68 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  29.5 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  26.98 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  25.18 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  29.12 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>