36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1892 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1892  Urea transporter  100 
 
 		 337 aa  665    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0862961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2440  Urea transporter  37.91 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0316485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3561  urea transporter  37.34 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.493557  normal  0.0101764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1138  urea transporter  37.34 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.138675  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1084  urea transporter  37.34 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1363  urea transporter, putative  35.6 
 
 		 350 aa  189  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.641348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2884  Urea transporter  34.42 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1245  Urea transporter  36.69 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1300  urea transporter  33.84 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1462  urea transporter  33.84 
 
 		 337 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4829  Urea transporter  31.44 
 
 		 286 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5121  urea transporter  34.46 
 
 		 338 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.47662 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0682  Urea transporter  34.13 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2711  putative UreA transporter  36.21 
 
 		 344 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4315  putative urea transporter  31.56 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2311  Urea transporter  30.33 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2354  Urea transporter  30.33 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2069  Urea transporter  33.92 
 
 		 281 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000722632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1868  transporter, putative  27.76 
 
 		 300 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.593615  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1593  Urea transporter  29.05 
 
 		 304 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1794  Urea transporter  26.81 
 
 		 314 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232092 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4302  Urea transporter  27.57 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4874  Urea transporter  27.82 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0687678  normal  0.634987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3867  Urea transporter  29.11 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39772  predicted protein  25.31 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.140327  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3688  Urea transporter  28.09 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4679  Urea transporter  28.09 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0971764 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3367  Urea transporter  26.71 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000898038  hitchhiker  0.0000000000000178503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4073  Urea transporter  29.11 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.413684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4532  Urea transporter  26.69 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1567  Urea transporter  30.04 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0796625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3627  Urea transporter  28.69 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.075407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03500  urea transporter  26.73 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1140  Urea transporter  27.55 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5621  Urea transporter  28.09 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2774  Urea transporter  27.27 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131823  normal  0.29539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>