21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4227 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4227  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.08 
 
 		 440 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.189228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.08 
 
 		 440 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3791  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.1 
 
 		 440 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.18 
 
 		 440 aa  190  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.113354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32570  two-component sensor  69.15 
 
 		 440 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.389083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2758  two-component sensor  69.15 
 
 		 440 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3934  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  71.05 
 
 		 441 aa  101  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.753143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2595  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 441 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  48.1 
 
 		 444 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 		 452 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2383  histidine kinase A-like protein  39.78 
 
 		 362 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00184355  hitchhiker  0.0000213821 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1413  histidine kinase  38.71 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2432  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 486 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4238  histidine kinase  41.05 
 
 		 514 aa  55.1  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0372163  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3431  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 450 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.039017  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3076  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 450 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.483241  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 438 aa  43.9  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3681  hypothetical protein  34 
 
 		 455 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.740643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0125  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 438 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0421257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4242  ATP-binding region, ATPase-like  28.28 
 
 		 463 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.450059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>