32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_63672 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  100 
 
 
712 aa  1481    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  37.93 
 
 
328 aa  97.8  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  37.93 
 
 
115 aa  97.4  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  32.88 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  42.99 
 
 
791 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 
838 aa  79.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  43.14 
 
 
756 aa  78.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  31.79 
 
 
180 aa  78.6  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36337  predicted protein  30.67 
 
 
900 aa  77.8  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  35.14 
 
 
119 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  32.32 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  35.78 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  41.18 
 
 
668 aa  70.9  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_6817  predicted protein  32.48 
 
 
106 aa  70.5  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280813  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  35.79 
 
 
103 aa  69.3  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  34.69 
 
 
109 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  36.08 
 
 
657 aa  63.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  35.71 
 
 
102 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9737  predicted protein  41.56 
 
 
95 aa  62  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.180116  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06446  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  44.62 
 
 
248 aa  62.4  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  32.69 
 
 
102 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9404  predicted protein  29.25 
 
 
96 aa  59.3  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386241  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00200  nucleolus protein, putative  42.31 
 
 
607 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00279  FlbDPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00658]  28.4 
 
 
314 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266348  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  26.61 
 
 
99 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7959  predicted protein  30.93 
 
 
98 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25549  predicted protein  30.71 
 
 
403 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51719  normal  0.155521 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32183  predicted protein  30.91 
 
 
246 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549576  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50365  predicted protein  29.41 
 
 
707 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899784  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04524  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  29.81 
 
 
332 aa  48.9  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0003189  normal  0.353141 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48179  predicted protein  23.57 
 
 
342 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13192  predicted protein  42.25 
 
 
74 aa  46.6  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>