13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00200 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00200  nucleolus protein, putative  100 
 
 		 607 aa  1235    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68096  predicted protein  24.81 
 
 		 578 aa  88.2  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0298848 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04618  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  29.94 
 
 		 724 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.330664  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25549  predicted protein  30.14 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.51719  normal  0.155521 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48179  predicted protein  25.82 
 
 		 342 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  38.3 
 
 		 712 aa  58.2  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  35.37 
 
 		 328 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  45.1 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  36.25 
 
 		 115 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  45.1 
 
 		 791 aa  45.4  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  45.1 
 
 		 668 aa  45.1  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  40.35 
 
 		 838 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  37.63 
 
 		 180 aa  43.9  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>