29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6839 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_6839  predicted protein  100 
 
 
101 aa  205  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15016  predicted protein  66.34 
 
 
119 aa  142  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34891  predicted protein  66.34 
 
 
180 aa  139  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_8749  predicted protein  51.49 
 
 
109 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_15516  predicted protein  56 
 
 
103 aa  114  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0761412  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40769  predicted protein  46.88 
 
 
102 aa  101  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0145425  normal  0.460561 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_6817  predicted protein  51.55 
 
 
106 aa  100  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.280813  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41981  predicted protein  42.27 
 
 
99 aa  95.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315481  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14143  predicted protein  42.55 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9540  predicted protein  42.55 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177599  normal  0.685809 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_9404  predicted protein  44.68 
 
 
96 aa  88.6  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0386241  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67483  predicted protein  38 
 
 
657 aa  85.1  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7959  predicted protein  45.36 
 
 
98 aa  83.6  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36337  predicted protein  42.57 
 
 
900 aa  82  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43387  predicted protein  40.66 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00279  FlbDPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00658]  38.61 
 
 
314 aa  80.5  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266348  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_47583  predicted protein  40.66 
 
 
328 aa  80.1  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9737  predicted protein  43.48 
 
 
95 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.180116  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07174  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  37.89 
 
 
305 aa  73.6  0.0000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0643653  normal  0.181525 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63672  predicted protein  36.7 
 
 
712 aa  72  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32183  predicted protein  37.62 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549576  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50365  predicted protein  36.08 
 
 
707 aa  68.2  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.899784  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31513  predicted protein  38.14 
 
 
756 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08377  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  35.64 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247587  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01590  conserved hypothetical protein  35.05 
 
 
838 aa  58.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.196806  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06446  putative Myb-like transcription factor (Eurofung)  40.91 
 
 
248 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35246  predicted protein  36.08 
 
 
668 aa  56.2  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0592899  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10944  Pre-mRNA-splicing factor cef1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW35]  35.05 
 
 
791 aa  55.8  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13192  predicted protein  37.5 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>